Modul Bankovní příkazy používá uživatel odpovědný za styk s bankou a umožňuje mu shrnout všechny požadavky z jednotlivých míst, kde se provádí likvidace došlých faktur, do příkazu do banky. Z těchto požadavků sestaví hromadný příkaz do banky, který potom odešle za pomocí software konkrétní banky do banky k provedení. Příkazy mohou být tuzemské i zahraniční. Příkaz je možno rozšířit o platby definované až v modulu Bankovní příkazy. Je zachována i alternativa papírových příkazů.