Štruktúra organizácie pre účely systému LZM Magion je prvotne riešená v úlohách Organizační jednotky (definované organizačné jednotky sa využívajú vo všetkých oblastiach systému Magion) a Pracovné miesta.
Organizačné jednotky
Číselník organizačných jednotiek predstavuje jeden zo základných číselníkov organizácie zachycujúci členenie organizácie na pracovisko, strediská, fakulty, závody apod. Obsahuje definíciu nadriadenosti a podriadenosti medzi organizačnými jednotkami a ďalšie údaje zachycujúcimi ich vlastnosti. Jednotlivé záznamy danej organizačnej jednotky sú určené identifikáciou organizačnej jednotky a dátumom počiatku platnosti organizační jednotky.
Organizačné jednotky sú naviazané na pracovné miesta. K jednej organizačnej jednotke môže byť priradené niekoľko pracovných miest, ale k jednému pracovnému miestu môže býť priradená iba jedna organizační jednotka.
Pracovné miesta
Úloha slúži k evidencii pracovných miest definovaných v rámci organizácie. Pracovné miesto je identifikované jednoznačným identifikátorom. Pracovné miesto je nositeľom informácií popisujúcich jeho vlastnosti a využívaných k vyhľadávaniu vhodných osôb pre obsadenie pracovného miesta, definícii náplne práce a činností vykonávaných na pracovnom mieste a pre stanovovanie požiadaviek na osoby, ktoré majú byť na pracovné miesto zaradené. K jednému pracovnému miestu je možné v jednom okamihu priradiť viac zamestnancov (napr. v prípade zastupovania, zaúčtovania), platí však i opačný vzťah, kedy jedného zamestnanca je možné priradiť na viac pracovných miest.
Spolu s evidenciou organizačných jednotiek zachycuje úplnú organizačnú štruktúru organizácie.