Firma MAGION s.r.o. vznikla v roce 1990. Jádro firmy tvořila skupina výzkumně-vývojových pracovníků Ústavu aplikací výpočetní techniky, kde vyvíjeli části překladače jazyka ADA a systémy řízení podniků.

V roce 1995 firma vyhrála výběrové řízení na tvorbu informačního systému Parlamentu ČR.

V roce 1995 byla založena dceřiná společnost MAGION - Tábor s.r.o.

V roce 1996 byl vytvořen a dodán pro Senát ČR systém pro evidenci senátorů a senátních tisků.

Od roku 1996 sídlí firma ve vlastních budovách v centru Vsetína.

Významným mezníkem v životě společnosti byl začátek roku 2001 kdy vznikl Magion system ,a.s., transformací firmy Magion s.r.o.

Dalším mezníkem v životě společnosti byl začátek roku 2003, kdy se Magion system, a.s. sloučila s firmou Sowa s.r.o. Vznikla tak kapitálově silnější společnost, která může pružněji reagovat na změny v oboru informačních technologií a služeb s nim spojených.